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次世代シークエンス解析用ソフトウェア CLC Genomics Workbench

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Ic equipment price 目安単価:

価格は相談により決定 

※別途、サービス料がかかります。
※サービス料には、システム利用料金および損害賠償保険が含まれます。
※取引条件によって、料金が変わります。

  • Ic equipment model number 型番:CLC Genomics Workbenc
  • Ic equipment spec 概要:次世代シークエンサーから出力される膨大なデータの解析に対応した統合配列解析ソフトウェアです。 最先端の解析アルゴリズムと高速なゲノムアセンブル・マッピングツール、豊富なグラフィカル機能や多彩な出力オプションを搭載し、ユーザーフレンドリーかつ直感的なインターフェイスで稼働します。
  • #核酸 #ゲノム #DNA #RNA #次世代シークエンサー #発現量 #変異 #エピジェネティクス #メチル化

    詳細・スペック

    利用可能時間
    平日9:00~17:00(左記時間外および土日祝は要相談)
    実験設備
    次世代シークエンス解析用ソフトウェア CLC Genomics Workbench
    詳細・スペック
    【オススメポイント】
    リシークエンシング解析:各種変異(SNV, InDel, CNV)の検出を行います。検出した変異には、アミノ酸置換情報や遺伝子名などをアノテーションとして付加することが可能です。
    トランスクリプトミクス解析:発現量データを網羅的に取得することができます。取得した発現量データは、専用ツールや無償プラグインを使用することで、サンプル間の発現変動解析やクラスタリングによる統計解析、ヒートマップやベン図作成によるグラフ表示を行うことが可能です。
    エピゲノミクス解析:転写因子とゲノム配列上の結合部位を同定します。ピーク領域近傍の遺伝子名をアノテーションとして取得するほか、無償プラグインの使用で、ヒストン修飾やバイサルファイトシークエンスの解析にも対応します。
    De novoシークエンシング解析:リード配列を直接つなげていき、コンティグ配列を作成します。作成したコンティグ配列は、原核生物ゲノムのORF予測や、BLASTによる相同性検索などに使用でき、配列決定から遺伝子機能の予測までをサポートします。

    【広さ】
    実験室約70 ㎡ 実験台1台をお貸しします! 

    【利用可能人数】
    制限はありませんが、3人以上の場合はご相談ください。

    【利用時間帯】
    ・平日9:00~17:00(左記時間外および土日祝は要相談)

    【実験設備】
    卓上遠心機、ブロックインキュベーター、ボルテックスミキサー、ピペットマン利用可能。その他、各種設備が利用可能ですのでお問い合わせください。

    【その他設備】
    ・インターネット(無線LAN)完備
    ・同フロア内に給湯器 / 男女トイレ / 休憩スペースあり
    ・同施設内に飲食店、スーパー、スターバックス、コンビニエンスストアあり
    ・大型エレベーター使用可能、搬入・運搬作業も簡単
    可能な実験例
    ・変異解析
    ・発現量解析
    ・エピジェネティクス解析
    ・新規ゲノム配列解析
    用途例
    ・正常部と腫瘍部を比較し、腫瘍特異的な変異を同定する。
    ・分化過程での発現量の違いを比較する
    ・微生物のゲノム配列を同定する
    ・転写因子の結合部位を同定する
    備考
    使用に当たっては「当社の機器利用および受託解析について(手引き)」に従って利用してください。(下記に一部抜粋)

    ・利用時間は原則 月~金(祝日及び年末年始を除く)9:00~17:00までとする。
    ・機器の初回利用者については当社技術職員のレクチャーを必ず受けること。
    ・当社利用申込書に所定の事項を明確に記入して提出すること。
    ・各機器を利用する場合には、本手引き及び当社技術職員の指示に従う。
    ・利用者は実験室の清潔・整頓に留意する。また利用後は必ず備え付けの利用簿に必要事項(利用者、利用時間、利用した消耗品数等)を正確に記入する。
    ・実験で生じるゴミについては、所定のゴミ箱に廃棄する。
    ・利用者のサンプルや器具等の原則保管は行わない。解析機器内に保存されているデータ類は原則として半年間保管する。それ以降は随時削除を行う。
    ・病原性、その他危険のおそれのあるもの及び化学物質を使用する場合は、事前に関係者の了解を得るとともに実験中及び実験終了後の消毒・その他万全の措置を講ずるものとする。
    ・上記に違反した場合、他人に迷惑を及ぼした場合には一定期間の利用を停止する。

    次世代シークエンス解析用ソフトウェア CLC Genomics Workbench

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