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次世代シークエンス解析用ソフトウェア CLC Genomics Workbench

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目安単価:

価格は相談により決定 

※別途、サービス料がかかります。
※サービス料には、システム利用料金および損害賠償保険が含まれます。
※取引条件によって、料金が変わります。

型番:CLC Genomics Workbenc

概要:次世代シークエンサーから出力される膨大なデータの解析に対応した統合配列解析ソフトウェアです。 最先端の解析アルゴリズムと高速なゲノムアセンブル・マッピングツール、豊富なグラフィカル機能や多彩な出力オプションを搭載し、ユーザーフレンドリーかつ直感的なインターフェイスで稼働します。

#核酸 #ゲノム #DNA #RNA #次世代シークエンサー #発現量 #変異 #エピジェネティクス #メチル化

詳細・スペック

利用可能時間
平日9:00~17:00(左記時間外および土日祝は要相談)
実験設備
次世代シークエンス解析用ソフトウェア CLC Genomics Workbench
詳細・スペック
【オススメポイント】
リシークエンシング解析:各種変異(SNV, InDel, CNV)の検出を行います。検出した変異には、アミノ酸置換情報や遺伝子名などをアノテーションとして付加することが可能です。
トランスクリプトミクス解析:発現量データを網羅的に取得することができます。取得した発現量データは、専用ツールや無償プラグインを使用することで、サンプル間の発現変動解析やクラスタリングによる統計解析、ヒートマップやベン図作成によるグラフ表示を行うことが可能です。
エピゲノミクス解析:転写因子とゲノム配列上の結合部位を同定します。ピーク領域近傍の遺伝子名をアノテーションとして取得するほか、無償プラグインの使用で、ヒストン修飾やバイサルファイトシークエンスの解析にも対応します。
De novoシークエンシング解析:リード配列を直接つなげていき、コンティグ配列を作成します。作成したコンティグ配列は、原核生物ゲノムのORF予測や、BLASTによる相同性検索などに使用でき、配列決定から遺伝子機能の予測までをサポートします。

【広さ】
実験室約70 ㎡ 実験台1台をお貸しします! 

【利用可能人数】
制限はありませんが、3人以上の場合はご相談ください。

【利用時間帯】
・平日9:00~17:00(左記時間外および土日祝は要相談)

【実験設備】
卓上遠心機、ブロックインキュベーター、ボルテックスミキサー、ピペットマン利用可能。その他、各種設備が利用可能ですのでお問い合わせください。

【その他設備】
・インターネット(無線LAN)完備
・同フロア内に給湯器 / 男女トイレ / 休憩スペースあり
・同施設内に飲食店、スーパー、スターバックス、コンビニエンスストアあり
・大型エレベーター使用可能、搬入・運搬作業も簡単
可能な実験例
・変異解析
・発現量解析
・エピジェネティクス解析
・新規ゲノム配列解析
用途例
・正常部と腫瘍部を比較し、腫瘍特異的な変異を同定する。
・分化過程での発現量の違いを比較する
・微生物のゲノム配列を同定する
・転写因子の結合部位を同定する
備考
使用に当たっては「当社の機器利用および受託解析について(手引き)」に従って利用してください。(下記に一部抜粋)

・利用時間は原則 月~金(祝日及び年末年始を除く)9:00~17:00までとする。
・機器の初回利用者については当社技術職員のレクチャーを必ず受けること。
・当社利用申込書に所定の事項を明確に記入して提出すること。
・各機器を利用する場合には、本手引き及び当社技術職員の指示に従う。
・利用者は実験室の清潔・整頓に留意する。また利用後は必ず備え付けの利用簿に必要事項(利用者、利用時間、利用した消耗品数等)を正確に記入する。
・実験で生じるゴミについては、所定のゴミ箱に廃棄する。
・利用者のサンプルや器具等の原則保管は行わない。解析機器内に保存されているデータ類は原則として半年間保管する。それ以降は随時削除を行う。
・病原性、その他危険のおそれのあるもの及び化学物質を使用する場合は、事前に関係者の了解を得るとともに実験中及び実験終了後の消毒・その他万全の措置を講ずるものとする。
・上記に違反した場合、他人に迷惑を及ぼした場合には一定期間の利用を停止する。

次世代シークエンス解析用ソフトウェア CLC Genomics Workbench

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