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委託
産学連携

(次世代シーケンサー)半導体マイクロチップでシーケンス反応と検出

概要

半導体マイクロチップでシーケンス反応と検出を行います。ホールゲノム、アンプリコンシーケンス / ターゲットリシーケンス、RNA-SEQ / ChIP-SEQ に対応可能です。
#次世代シーケンサー #遺伝学的検査

詳細・スペック

詳細・スペック
ホールゲノム、アンプリコンシーケンス / ターゲットリシーケンス、RNA-SEQ / ChIP-SEQ に対応です。

The Ion PGM™ Systemは、信頼性の高い次世代シーケンシングプラットフォームです。ターゲットDNAシーケンス、ターゲットRNAシーケンス、微生物de novoシーケンス、微生物研究などに最適化されたデータ解析ワークフローを行います。
Ion PGM™ シーケンサーの主要な解析ソフトウェアとして、シグナル処理、塩基配列決定、リードアライメント、バリアント判定を実行するTorrent Suite™ ソフトウェアを搭載しています。
可能な実験例
ターゲットDNAシーケンス
ターゲットRNAシーケンス
small RNAシーケンス
コピー数解析
微生物ゲノムシーケンス
de novo
ChIPシーケンス
SNP解析
場所・アクセス
契約形態
備考
鳥取地区:鳥取市湖山町南4-101、米子地区:米子市西町86
その他
料金は事前調整の上決定します。
 
※事前調整を行いますので、先ずは研究基盤センターに研究内容等をご相談下さい。
 (相談先のE-mail: grc@med.tottori-u.ac.jp)
 検体をお預かりし、ライブラリ作製・シーケンスを行います。
 得られたシーケンスデータより、分析レポート(バイオインフォマティクス)を作成し、ご報告します。
 
 また、これらの詳細情報につきましては、以下のURLをご参照ください。
  http://grc2.med.tottori-u.ac.jp/shared_research_equipment/eqpt_028425.html
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