（次世代シーケンサー）半導体マイクロチップでシーケンス反応と検出

詳細・スペック

契約形態

備考

その他

料金は事前調整の上決定します。
　
※事前調整を行いますので、先ずは研究基盤センターに研究内容等をご相談下さい。
　（相談先のE-mail: grc@med.tottori-u.ac.jp）
　検体をお預かりし、ライブラリ作製・シーケンスを行います。
　得られたシーケンスデータより、分析レポート（バイオインフォマティクス）を作成し、ご報告します。
　
　また、これらの詳細情報につきましては、以下のURLをご参照ください。
　　http://grc2.med.tottori-u.ac.jp/shared_research_equipment/eqpt_028425.html

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詳細・スペック

ホールゲノム、アンプリコンシーケンス / ターゲットリシーケンス、RNA-SEQ / ChIP-SEQ に対応です。

The Ion PGM™ Systemは、信頼性の高い次世代シーケンシングプラットフォームです。ターゲットDNAシーケンス、ターゲットRNAシーケンス、微生物de novoシーケンス、微生物研究などに最適化されたデータ解析ワークフローを行います。
Ion PGM™ シーケンサーの主要な解析ソフトウェアとして、シグナル処理、塩基配列決定、リードアライメント、バリアント判定を実行するTorrent Suite™ ソフトウェアを搭載しています。

可能な実験例

ターゲットDNAシーケンス
ターゲットRNAシーケンス
small RNAシーケンス
コピー数解析
微生物ゲノムシーケンス
de novo
ChIPシーケンス
SNP解析

用途例

ヒト疾患
遺伝性疾患
細菌やウイルスの動態研究・分類学
がん研究
幹細胞研究
農業・農学研究
エピゲノム
メタゲノム
科学捜査
古代DNAゲノミクス