解析パイプライン作成【現役神経科学者(M.D., Ph.D.)が作成/オンライン依頼】

詳細・スペック

おすすめポイント

①査読付き論文作成経験のある現役研究者（M.D./Ph.D.）が解析/納品。
②論文などで読んだ「最先端の解析」も、論文を読み込みながら実現いたします。
③医学部/企業での受託解析経験が豊富にあります。

Webサイト： https://www.araya.org/rdx/

【論文化された活用事例(MRI 解析)】（一部）
Hagiwara A, Hori M, Yokoyama K, Nakazawa M, Ueda R, Horita M, Andica C, Abe O, Aoki S (2017) Analysis of white matter damage in patients with multiple sclerosis via a novel In vivo MR method for measuring myelin, axons, and G-Ratio. AJNR Am J Neuroradiol 38:1934–1940.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28775058/

Orihashi R, Mizoguchi Y, Imamura Y, Yamada S, Ueno T, Monji A (2020) Oxytocin and elderly MRI-based hippocampus and amygdala volume: a 7-year follow-up study. Brain Commun 2:fcaa081.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32954331/

納期目安

最短30日

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実験設備

ワークステーション(CentOS・実費)に
1. 代表的な解析ソフトウェア群
2. アラヤ作成の解析パイプライン
をセットアップ致します(構成は応相談)。フォルダを選択するだけで、最新の処理を自動で行えます。

【メニュー】
①基本セットアップ :ワークステーションの基礎的セットアップ
②拡散 MRI パイプライン
- 前処理、DTI 計算(FA/MD/AD/RD 画像出力)、NODDI 画像、出力、TBSS/GBSS 解析、Probabilistic tractography

③安静時 fMRI パイプライン
- 前処理、ノイズ除去、ROI-to-ROI 結合、グ-ラフ理論指標計算他

④構造 MRI パイプライン
- 前処理、Voxel-based morphometry (VBM) 、Surface-based morphometry (surface area, thickness, etc)

⑤拡散・構造前処理パイプライン
- HCP 等の前処理パイプラインの導入サポート

⑥拡散・構造・安静時 fMRI 統合パイプライン
- HCP 等の前処理パイプライン・解析(parcellation に基づく個人ごとの拡散画素値と解剖学的指標の自動出力)導入サポート

⑦拡散・構造・安静時 fMRI 統合パイプライン +tractography

⑧課題 fMRI パイプライン

用途例

・脳データを取得したものの解析が手間な時に
・自分が行っている解析を研究室の他の人にも共有したいときに
・脳データを取得したいものの、取得方法や解析方法がわからない時に
・学術的にきちんと解析できているか不安な時に
・神経科学者の力を借りたい時に