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解析パイプライン作成【現役神経科学者(M.D., Ph.D.)が作成/オンライン依頼】

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Ic equipment pin 場所:日本/海外の両方からご依頼いただけます。
  • Ic equipment spec 概要:フォルダを選択するだけで、最新の処理を自動で行えるパイプラインをご提供。
  • #自動化 #MRI #脳 #画像 #認知神経科学

    詳細・スペック

    おすすめポイント
    ①査読付き論文作成経験のある現役研究者(M.D./Ph.D.)が解析/納品。
    ②論文などで読んだ「最先端の解析」も、論文を読み込みながら実現いたします。
    ③医学部/企業での受託解析経験が豊富にあります。

    Webサイト: https://www.araya.org/rdx/

    【論文化された活用事例(MRI 解析)】(一部)
    Hagiwara A, Hori M, Yokoyama K, Nakazawa M, Ueda R, Horita M, Andica C, Abe O, Aoki S (2017) Analysis of white matter damage in patients with multiple sclerosis via a novel In vivo MR method for measuring myelin, axons, and G-Ratio. AJNR Am J Neuroradiol 38:1934–1940.
    https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28775058/

    Orihashi R, Mizoguchi Y, Imamura Y, Yamada S, Ueno T, Monji A (2020) Oxytocin and elderly MRI-based hippocampus and amygdala volume: a 7-year follow-up study. Brain Commun 2:fcaa081.
    https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32954331/
    納期目安
    最短30日
    会員限定コンテンツ
    無料登録で料金など全ての情報を閲覧可能
    実験設備
    ワークステーション(CentOS・実費)に
    1. 代表的な解析ソフトウェア群
    2. アラヤ作成の解析パイプライン
    をセットアップ致します(構成は応相談)。フォルダを選択するだけで、最新の処理を自動で行えます。

    【メニュー】
    ①基本セットアップ :ワークステーションの基礎的セットアップ
    ②拡散 MRI パイプライン
    - 前処理、DTI 計算(FA/MD/AD/RD 画像出力)、NODDI 画像、出力、TBSS/GBSS 解析、Probabilistic tractography

    ③安静時 fMRI パイプライン
    - 前処理、ノイズ除去、ROI-to-ROI 結合、グ-ラフ理論指標計算他

    ④構造 MRI パイプライン
    - 前処理、Voxel-based morphometry (VBM) 、Surface-based morphometry (surface area, thickness, etc)

    ⑤拡散・構造前処理パイプライン
    - HCP 等の前処理パイプラインの導入サポート

    ⑥拡散・構造・安静時 fMRI 統合パイプライン
    - HCP 等の前処理パイプライン・解析(parcellation に基づく個人ごとの拡散画素値と解剖学的指標の自動出力)導入サポート

    ⑦拡散・構造・安静時 fMRI 統合パイプライン +tractography

    ⑧課題 fMRI パイプライン
    用途例
    ・脳データを取得したものの解析が手間な時に
    ・自分が行っている解析を研究室の他の人にも共有したいときに
    ・脳データを取得したいものの、取得方法や解析方法がわからない時に
    ・学術的にきちんと解析できているか不安な時に
    ・神経科学者の力を借りたい時に

    Ic equipment price 目安単価:

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    その他の実験委託

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