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検索結果:産学連携カテゴリ「ゲノム」(11件)

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      産学連携

    ゲノム編集マウスの作製(KO)

    Thumb 0b1b1822 3d5a 4e64 9fcd 7f8ba5b55704

    国立大学の専門家がゲノム編集技術を利用してノックアウトマウスを作製します。

    ・専門家による確かな技術
    ・ゲノム編集によるノックアウト

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      産学連携

    超音波による核酸の断片化

    Thumb 8baf6083 f1bc 4d06 89c9 f5d63bd0f81a

    超音波により核酸を断片化します。それに加えて、培養細胞、酵母などを破砕し、タンパク質の抽出などにも利用できます。 本機器では500kHz程の超音波を一極に集中させることで、再現性の高い超音波処理を実現します。これによって抽出・解析試料の変性や失活等の原因となる温度上昇を抑えながら作業を行...

    可能な実験例

    DNA、RNAシーケンス等の前処理 DNA(RNA) Shearing / 断片化、ChIP Assay, Chromatin DNAの断片化、FFPEからの試料抽出、細胞破砕、核酸/タンパク質/代謝物抽出、核酸精製、たんぱく質抽出、NGSライブラリ作製

    用途例

    ヒト疾患
    遺伝性疾患
    細菌やウイルスの動態研究・分類学
    がん研究
    幹細胞研究
    農業・農学研究
    エピゲノム
    メタゲノム

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      産学連携

    がん、プロテオーム研究に/レーザーマイクロダイセクション

    Thumb da88e804 18a1 4fd8 9dde a28321660f20

    レーザーマイクロダイセクターを用いた特定領域の回収

    用途例

    ・がん研究
    ・単一細胞のダイセクション
    ・プロテオーム解析

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    次世代シークエンス解析用ソフトウェア CLC Genomics Workbench

    Thumb 8f9ca9e9 456a 43de 953d 1a4af3fe2b03

    次世代シークエンサーから出力される膨大なデータの解析に対応した統合配列解析ソフトウェアです。 最先端の解析アルゴリズムと高速なゲノムアセンブル・マッピングツール、豊富なグラフィカル機能や多彩な出力オプションを搭載し、ユーザーフレンドリーかつ直感的なインターフェイスで稼働します。

    用途例

    ・正常部と腫瘍部を比較し、腫瘍特異的な変異を同定する。
    ・分化過程での発現量の違いを比較する
    ・微生物のゲノム配列を同定する
    ・転写因子の結合部位を同定する

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    蛍光強度による核酸濃度測定 Qubit

    Thumb e7d08195 bbdf 467c b36d 2a19424b0c79

    Qubitは結合した場合にのみ発光するターゲット分子に特異的な蛍光色素を使用して、蛍光強度による核酸濃度測定します。 DNA およびRNAは時間が2分間、タンパク質は15分間という短時間のインキュベートで濃度の測定を行えます。 Qubit® 3.0 蛍光光度計では、装置上に最高1,000 ...

    可能な実験例

    組織・細胞・血漿・FFPEなどから精製したDNA, RNA, タンパク質の濃度を測定する

    用途例

    ヒト疾患
    遺伝性疾患
    細菌やウイルスの動態研究・分類学
    がん研究
    幹細胞研究
    農業・農学研究
    エピゲノム
    メタゲノム

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      産学連携

    超高感度・高精度 絶対定量解析システム デジタルPCR QX200 *訪問利用は要相談

    Thumb 9fa0de59 8db2 4c48 923d 1595b71d985e

    対立遺伝子変異(SNPs)の検出、微量発現遺伝子定量、リアルタイムPCRでは検出することが難しい遺伝子の微量な変化などのモニタリングにおいて、従来の解析レベルを飛躍的に向上させる超高感度で絶対的な核酸定量システムです。

    用途例

    ・単一ウェルにおける絶対定量を用いた正確なCNV定量
    ・がんや疾患での希少変異検出
    ・代謝速度が早い反応経路における微量発現mRNAおよびmiRNAの検出
    ・臓器移植、土壌および食品におけるウイルス量および病原体検出への応用

    • 委託
      産学連携

    全自動核酸電気泳動 TapeStation *訪問利用は要相談

    Thumb 04c04df2 d579 4b2f 9d45 3653dff6a0c3

    DNAおよび RNA サンプルの品質管理のための全自動電気泳動ソリューションシステム DNA および RNA のサンプルの品質管理(QC)に適した全自動電気泳動システムであり、装置とデータ解析用ソフトウェア、専用の ScreenTape と試薬を使用することにより、サンプルのサイズ、濃度、分...

    用途例

    ・PCR産物の確認
    ・genome DNA、RNAの分解度の確認

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      産学連携

    次世代シークエンサー

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    10Gb~1Tb、または3億~40億リードの出力が可能であるIllumina社の次世代シーケンスプラットフォームです。Rapidモードと高出力モードの2種類のランモードを搭載しています。研究内容に沿ったスケール対応が可能です。Rapidモードは、装置内でクラスター形成およびシーケンスを全自動で...

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      産学連携

    (次世代シーケンサー)半導体マイクロチップでシーケンス反応と検出【lon PROTON-410】

    Thumb 350592cc c2c8 408d 91a9 9f8b4b73a06e

    半導体マイクロチップでシーケンス反応と検出を行います。ヒトゲノム、ヒトエクソーム、ホールトランスプリプトーム、RNA-SEQ、ChIP-SEQに対応可能です。

    可能な実験例

    ヒトスケールゲノムシーケンス
    エクソームシーケンス
    トランスクリプトームシーケンス
    コピー数解析
    ChIPシーケンシング
    ターゲットRNAシーケンス

    用途例

    癌研究
    遺伝性疾患
    農業・農学研究
    幹細胞
    エピジェネティクス

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      産学連携

    (次世代シーケンサー)半導体マイクロチップでシーケンス反応と検出

    Thumb b35a24b0 ed47 4922 8eff da9e0a1a20e6

    半導体マイクロチップでシーケンス反応と検出を行います。ホールゲノム、アンプリコンシーケンス / ターゲットリシーケンス、RNA-SEQ / ChIP-SEQ に対応可能です。

    可能な実験例

    ターゲットDNAシーケンス
    ターゲットRNAシーケンス
    small RNAシーケンス
    コピー数解析
    微生物ゲノムシーケンス
    de novo
    ChIPシーケンス
    SNP解析

    用途例

    ヒト疾患
    遺伝性疾患
    細菌やウイルスの動態研究・分類学
    がん研究
    幹細胞研究
    農業・農学研究
    エピゲノム
    メタゲノム
    科学捜査
    古代DNAゲノミクス

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