検索結果：すべてのカテゴリ「ゲノム解析」（8件）

・衛生環境が整っている
・2フロア合計5室の広い施設
・機器の持ち込みが可能
・RNAやDNAの解析機器が充実

iPS細胞などの細胞または臨床検体、微生物などを用いたDNA解析/ゲノム解析の他、FT-IRやGC/MSでの分析も可能です。
試薬調製/リアルタイムPCR/セルベースアッセイ/アガロースゲル電気泳動/核酸抽出/RNA抽出/DNA抽出/核酸精製/in vitro試験/DNAシーケンス解析/FT-IR/GC/MS/他

・メッセンジャーレベルでの遺伝子発現量の解析
・臨床検体の網羅的な遺伝子発現量の解析
・マイクロバイオームの評価
・化合物や開発品の効果/薬効の解析や作用メカニズム/薬理の解析

・RT-PCR装置12台（自社開発品）を独占使用可能——複数サンプルの並行処理や大量測定に対応できる民間施設は大阪でも希少
・次世代シーケンサー（Ion Genexus-S2 / サーモフィッシャー）を完備——ゲノム解析・遺伝子発現解析を1ヶ所で完結
・BSL2（P2）対応環境——SARS-CoV-2等の病原体取扱い実績があり、臨床検体（唾液・血液等）を用いた実験が可能
・専有利用で他者の実験と干渉しない——機密性が求められる研究・受託前の検証実験にも対応
・機器持ち込み可（100V電源）・廃液対応可・Wi-Fi利用可——短期スポット利用から月単位まで柔軟に対応

・RT-PCR法による核酸増幅実験
・次世代シーケンシング（Ion Genexus-S2を使用したゲノム解析）
・遺伝子発現解析
・臨床検体（唾液・血液）を用いたウイルス検出試験
・SARS-CoV-2等の病原体を用いた実験（BSL2環境）
・細胞培養実験（安全キャビネット使用）
・PCR産物の品質確認（QCツール使用）

・製薬企業・バイオ系スタートアップが、自社ラボ整備前の早期フェーズでPCR・シーケンス解析環境を短期確保したい場合
・自社研究室では対応できないBSL2レベルの検体（臨床由来サンプル等）を扱う実験を民間施設でスポット実施したい場合
・感染症関連の受託検査を立ち上げる企業が、試験導入前のプロセス検証（バリデーション）を行う場合
・遺伝子解析機器を自社で持たないCRO・研究機関が、Ion Genexus-S2を使ったシーケンシングをスポット利用したい場合
・試薬メーカーや診断薬メーカーが、新規キットの評価試験を外部BSL2環境で実施したい場合

・BSL2の細胞(HeLa、HEK293T、iPSなど)で遺伝子組み換えや遺伝子編集(ゲノム編集)ができます
・BSL2検体の取り扱いや実験のサポートも可能
・ウイルスベクターの構築から調製、導入までのDNAワークができます
・臨床検体を用いたゲノム解析やDNAマイクロアレイの作製も可能
・冷却超遠心機でのエクソソームの精製も可能

iPS細胞などの細胞または臨床検体などを用いたDNA解析/ゲノム解析の他、汎用的な分子生物学的な解析が可能です。
試薬調製/タンパク定量(BCAアッセイ)/質量分析/リアルタイムPCR/細胞増殖/セルベースアッセイ/アガロースゲル電気泳動/核酸抽出/RNA抽出/DNA抽出/核酸精製/エクソソーム精製/in vitro試験/DNAシーケンス解析/DNAマイクロアレイ解析/ライブラリー調製/遺伝子組み換え/遺伝子編集(CRISPR-Cas9)/ノックダウン実験(siRNA導入)/核酸導入/蛍光染色/免疫染色/他

・臨床検体の網羅的な遺伝子発現量の解析
・化合物や開発品の効果/薬効の解析や作用メカニズム/薬理の解析
・HTSなどの大規模スクリーニング試験の予備解析や条件検討
・毒性試験や安全性試験
・医薬品や化粧品の細胞評価
・培養上清やエクソソームの機能性評価

細菌の系統学的分類の指標として用いられる16SリボソームRNA遺伝子を利用し、メタゲノム解析を行うことで、細菌叢の構成を明らかにすることが出来る。
皮膚、糞便、唾液のサンプルから解析を行うことが可能である。
細菌叢の解析は、アレルギーなどの疾患との因果関係が指摘されていることから昨今、注目を集める分野の一つである。

【おすすめポイント】
PacBioシーケンスとは、圧倒的に長いリードを獲得できる手法です。
最大リード長40kb、平均リード長10kb以上のシーケンスを行うことができるため、細菌の完全長ゲノム配列の作成を可能です。
さらに、ショートリードのデータを組み合わせ完全長ゲノムの構築を目指す方法では解析が困難であったリピート配列、スプライシングバリアントの読み分けに特に有効な技術となります。

Co-LABO MAKERは複数の大学・企業と連携し、お客様のニーズに寄り添ったオーダーメイドの解析を実現しています。

【PacBioシーケンスとは】
PacBio社のシーケンス技術はSMRT(single molecule real-time) sequenceという技術による次世代のシーケンス技術です。これは、長く断片化したnative DNAを鋳型としたDNA合成を、百万単位の小孔内で同時に行うことでデータを取得します。特徴として、長いリード長が得られること、一分子を読むことができること、サンガー法に比類する精度が得られること、GC含量に左右されず均一なカバレッジが得られること、エピジェネティクス情報を解析可能であることなどが挙げられます。

【適応範囲】
適用事例として以下のものがあげられます。

・全長cDNAシークエンシング
ロングリードが得られることを利用し、スプライシングバリアントの異なる発現遺伝子を一気にシークエンスすることで、より細かい遺伝子の分類・識別ができます。

・ロングアプリコンシーケンス
クローニングなしで行うサンガーシーケンスではシス/トランスのSNP情報が損なわれてしまいます。しかし、本手法ならばこの情報を損なうことなく一気に読み切ることができます。

【納期目安】
サンプルの量やデータ量などによって異なりますので、まずはお問合せください。

【こんなことが出来ます】
農産物や発酵食品、植物、土壌、水などから有用な乳酸菌や酵母、カビなどを分離・培養致します。
新たな食品・地域特産品の開発に向けて、地域資源（植物や環境など）や発酵食品から有用な乳酸菌や酵母を探してみませんか？

＊特産品開発には補助金が出ている場合がございますのでご確認ください。

（実験例）
・植物からの微生物の単離・培養
・環境（土壌、水）からの微生物の単離・培養
・ぬか床からの微生物の単離・培養
・酒からの酵母の単離・培養
・発酵食品（漬物、キムチなど）からの乳酸菌の分離・培養

分離した微生物のゲノム解析も実施可能です。

☆コラボメーカーのメリット☆
・製品開発に伴う外注業務をまるっとサポート
・抗菌・抗ウイルス試験・安全性試験・有効性試験などもまとめて受託可能

【試験先の特徴】
細菌研究のエキスパートがヘルスケア研究や食品開発をサポート！

【こんなことができます！】

☆腸内細菌の解析
☆ゲノム解析
☆健康を軸に置いた食品
・自社製品の有効性を検証
・腸内細菌だけでなく、土壌細菌なども解析可能
・菌のスクリーニング
・論文調査
・動物実験
・食品開発

（実験例）

【製品の有効性を示すエビデンスが欲しい】
・通常マウスに有効成分を摂取させ、腸内細菌を解析、摂取による変化の結果を確認してエビデンスを得たい。

【新製品を開発したい】
・商品化に使用する、オリジナルの菌を分離して、培養をする
・健康をキーワードにした商品を開発する。
・製品に入れる成分の効果を動物を使って確かめたい。

【研究・開発で実験を行いたい】
・特定の疾患の研究をしており、腸内細菌のデータを取得したい。
・疾病モデルのマウスに有効成分を摂取させた時の変化を見たい。

☆コラボメーカーを通すメリット☆
・製品開発に伴う外注業務をまるっとサポート
・抗菌・抗ウイルス試験・安全性試験・有効性試験などもまとめて受託可能
・補助金申請等のご支援もさせていただきます！

特定保健用食品、機能性表示食品、栄養機能食品、サプリメント